Masjid ini dibina pada tahun 1964 daripada derma orang ramai dan kerajaan.
Kerajaan Persekutuan melalui ICU Negeri Melaka telah memulakan pembinaan masjid pembinaan masjid baru Paya Datuk. Pembinaan adalah dengan mengekalkan struktur bangunan lama. Kos pembinaan masjid baru Paya Datuk dengan kos RM3,030,303.00 dan telah siap sepenuhnya pada 20 November 2014.
Pada 13 Mac 2014, Ketua Pengarah ICU telah membuat kawatan dan menyaksikan penyerahan rasmi masjid dari ICU kepada Pengerudi Jawatankuasa Masjid.
BINAAN
KEMUDAHAN
1. Bilik pejabat
2. Bilik mesyuarat
3. Bilik mandi jenazah